Přístup strojového učení využívající markery metylace DNA z krve klasifikoval ve studii vysoce rizikové skupiny s přesností přibližně 90 procent.
Pokud by se to zpřesnilo do praktického testu, mohlo by to podpořit dřívější a cílenější prevenci bez časově náročných klinických studií.
Prediabetes je často považován za jeden pojem, ale biologicky se může u jednotlivých osob velmi lišit.
Někteří lidé zůstávají po léta stabilní s relativně nízkým rizikem.
Jiní rychle postupují k diabetu 2. typu nebo se u nich vyvinou komplikace.
Tato variace je důležitá, protože prevence není univerzální – a správná intenzita podpory závisí na tom, kdo je skutečně vystaven vysokému riziku.
Výzkumníci z partnerských institutů v rámci Německého centra pro výzkum diabetu se snažili usnadnit a zpřesnit posouzení rizika.
Předchozí výzkum naznačil, že prediabetes lze rozdělit do nejméně šesti klastrů, z nichž každý má odlišný metabolický profil a odlišnou pravděpodobnost progrese a komplikací.
Problém je v tom, že zařazení osoby do těchto klastrů obvykle vyžaduje podrobné testování – orální glukózové toleranční testy, měření inzulínu a zobrazovací metody.
To je pro rutinní použití ve velkém měřítku příliš pomalé a náročné na zdroje.
V této studii vědci zkoumali, zda by biomarkery z krve mohly nabídnout zkratku.
Kombinovali analýzu metylace DNA – způsob měření chemických značek na DNA, které ovlivňují aktivitu genů – se strojovým učením.
Cílem bylo identifikovat epigenetický podpis, který spolehlivě označuje vysoce rizikové klastry.
Jejich model použil 1 557 epigenetických markerů měřených v krvi.
S využitím těchto markerů vědci uvedli, že mohou přiřadit lidi do vysoce rizikových klastrů prediabetu s přesností přibližně 90 %, a to i v nezávislé validační skupině.
Mnoho markerů bylo specifických pro jednotlivé klastry a zdálo se, že mapují na různé biologické dráhy, což podporuje myšlenku, že klastry odrážejí skutečně odlišné základní biologické charakteristiky, spíše než libovolné kategorie.
Mnoho z těchto markerů již bylo v jiných epigenetických studiích spojeno s diabetem 2. typu, chronickým zánětem a kardiovaskulárním a ledvinovým onemocněním.
To je důležité, protože naznačuje, že test nejen odráží aktuální stav hladiny cukru v krvi, ale také zachycuje širší biologii rizika, která by mohla formovat budoucí výsledky.
Pokud lze tento přístup převést do praktického testu, důsledky jsou významné.
Namísto spoléhání se na časově náročná hodnocení by lékaři mohli použít standardizovaný krevní test ke stratifikaci rizika a poté odpovídajícím způsobem přizpůsobit intenzitu prevence – asertivnější intervence pro osoby s nejvyšším rizikem a méně důkladnou podporu tam, kde je riziko nižší.
Výzkumníci netvrdí, že mají hotový diagnostický nástroj.
Jejich dalším krokem je zúžit soubor markerů, aby se stal levnějším a lépe použitelným v rutinní diagnostice, s dlouhodobým cílem vyvinout specializovaný analytický čip.
Směr je jasný – přejít od obecných označení k cílené prevenci založené na měřitelné biologii, poskytované prostřednictvím testu, který je dostatečně jednoduchý na to, aby se dal široce používat.
Zdroj: diabetes.co.uk
